性质不同：百花蜜是多种花蜜酿成的混合蜂蜜，味甜，具有天然蜜的香气，营养成分比较多。蜂蜜是蜜蜂从开花植物的花中采得的花蜜，在蜂巢中经过充分酿造而成的天然甜物质。气味清香浓郁，味道纯真甜美。主要营养成分不同：百花蜜含有果糖、多种氨基酸、维生素和微量元素。蜂蜜含有蛋白质、脂肪、碳水化合物、钠等元素。
价值功效不同：百花蜜主要食用功效：促进新陈代谢、调节免疫、助长发育、增强记忆、健肠胃、促进血液循环、保肝、消炎、镇痛、延年益寿等多种作用，常食用可以提高青少年的免疫力，助长发育、增强记忆、可以预防和纠正儿童的贫血。蜂蜜主要食用功效：清热，补中，润燥，止痛，解毒，减肥，美白，使皮肤光洁细嫩。普通蜂蜜大多是单花蜜，而百花蜜是多花蜜。单花蜜有明确的自己独有的物理特性，比如蜂蜜的颜色、它的特有固定的味道，还有它的结晶特性等等;而百花蜜这种特性不明显，每一种可能都不一样，比如味道、颜色和结晶特性，因为它的蜜源构成不确定。