查干湖湿地形成的条件有自然因素也有人为因素存在。查干湖是历史上是嫩江的主河道的一段，由于地质运动等原因，嫩江改道东移，而查干湖所处地域地势平坦，河流摆动造成的泥沙淤积等原因导致排水不畅，于是就形成了查干湖这一自然湖泊。
但是查干湖的入湖河流逐渐干旱，导致查干湖在二十世纪七十年代初期几乎干涸，原湖泊地区风沙肆虐，对周围生态和农业造成严重影响，于是当地政府决定"引松入湖”，在当时没有大型机械的情况下，全靠人力建成了全长53.85公里，宽5米的人工渠"引松渠”，松花江的水通过引松渠流入查干湖，形成了如今的查干湖湿地。