民国二十四年（1935年），奉节县引进了普通甜橙和红桔定植。1953年，奉节脐橙正式开始在奉节县进行选育，至1972年，已成功选育出奉园72—1母树。四川省通过有关科研单位鉴定，并于1973年高接换种105株，建立第一代无性繁殖母本园。1977年，中国农业科学院举办新选育柑橘新良种鉴定会，奉节脐橙获得第一名，从此奉园72—1脐橙和奉节地名联系到一起，被直接称之为“奉节脐橙”，逐渐在全国有了知名度。
1979年1月，国家计委、外贸部决定在奉节县建设出口脐橙基地县，开始在全县发展，并于1980年形成商品产量，至此奉节脐橙很快为消费者所熟知。2000年，重庆市农业经济作物审定委员会，将奉园72—1脐橙正式审定命名为“奉节脐橙”。2006年，国家工商总局正式批准“奉节脐橙”为地理证明商标。