1、定义不同
撤职是对于违犯党的纪律的党员的一种纪律处分，而免职则属于干部任用的一种制度，不是纪律处分。
2、性质不同
撤职具有惩戒性，体现了人大常委会对有关国家机关工作人员的监督，而免职是正常工作变动的结果。
3、原因不同
撤职是因为被撤职人员有过错，如违反纪律、工作严重失误，甚至有违法犯罪行为等。而免职可以适用于包括因调任其他工作、轮岗交流、任职期满、退休等因素而引起的免除其所任职务的行为。
4、程序不同
撤职的程序复杂、严格，免职程序简单。人大常委会对撤职既可以是被动的，也可以是主动的，除有关机关或者人员可以依法提出撤职案外，人大常委会组成人员也可依法提出撤职案。
5、实施范围不同
全国人大常委会以及地方各级人大常委会可以行使免职权，但撤职权却只有地方各级人大常委会才享有。