1、大小不同：丑橘的个头一般要高过耙耙柑，耙耙柑的个头都比较均匀，大多售卖时个头比较均匀一致，一般单个重量都在半斤左右，而丑橘大个的一斤左右也不鲜见。
2、果皮的颜色也有明显差别：丑橘果皮颜色一般为浅橘色，耙耙柑的果皮颜色要明亮很多，基本都是深橘色，这个仔细一看就能分辨的很清楚。
3、外包装上有差别：耙耙柑曾经因为在运输过程中容易挤压变形，导致品质受到损害而使种植户受到过很大的损失。后来经销商发现用纸包裹住耙耙柑可以使耙耙柑免受挤压的损伤，因此才开始在全国各地热销，所以购买耙耙柑时可以看其是否包裹了保护纸，一般包裹保护纸的都是耙耙柑，因为丑橘无需包裹也可以长途运输。
4、果肉的形状不一样：丑橘的瓣要比耙耙柑大一些，掰开果肉虽然两者都呈米粒状，但耙耙柑的果肉明显水分要多过丑橘一些。