土壤污染具有难治理性。需要花费大量的人力、物力、财力来进行治理，并且不一定会取得很好的成效。土壤污染具有不均匀性。有机污染物的堆积、填埋会造成土壤污染，同时污染物的堆积和填埋往往不均匀，会导致同一块土地不同的地方污染程度不一致。土壤污染具有难以察觉性。土壤污染对人体的损害不明显，必须通过体检时化验等手段才能发现，对植物的损害也只有进行农作物抽验时才能发现。
土壤污染具有累积性。由于土壤是固体，流动性差，难以进行自净，因此造成土壤污染的因素不断的累积，对植物、动物以及人体造成严重损害。土壤污染具有难逆性。重金属导致的土壤污染难以逆转，各种有机污染物导致的土壤污染也很难降解，并且很难通过技术手段进行治理，再加上治理过得土壤仍然比污染前的土壤差。